Wiosną 2001 roku metodologię wykładania założeń islamu profesora Shedingera zakwestionowała jedna z jego studentek muzułmańskiego wyznania. Dziewczyna skarżyła się, że profesor przedstawia islam całkowicie inaczej niż jej rodzice. Jak mówi Shedinger, zdarzenie to zmusiło go do ponownego przemyślenia całej koncepcji religii i tego, jak wykłada ją on studentom.

„Musiałem ponownie zastanowić się nad samym pojęciem „islam” i doszedłem do wniosku, że jest to społeczny ruch na rzecz sprawiedliwości. Sądzę, że właśnie takie idee głosił Chrystus w pierwszym wieku. Dlatego stwierdzam, że Jezus był najprawdopodobniej muzułmaninem” – powiedział profesor.

Najpoważniejszym zarzutem przeciw teorii Shedingera jest to, że Jezus Chrystus urodził się 600 lat przed powstaniem islamu i jeśli głosił on poglądy charakterystyczne dla islamu, oznacza to, że muzułmanie mogli je zapożyczyć od chrześcijan.

Biorąc pod uwagę fakt, że islam narodził się znacznie później od chrześcijaństwa, przeciwnicy autora książki „Czy Jezus był muzułmaninem?” zadają mu przeciwstawne pytanie” „Czy Mahomet był chrześcijaninem?”.